Kajian Kitab Kuning
Pengkajian mendalam kitab-kitab klasik ulama salaf dengan metode bandongan dan sorogan bersama Kyai.
Kajian Kitab Kuning adalah ruh dari pendidikan pesantren. Di Qurrota A'yun, kajian ini dilakukan dengan dua metode utama:
Metode Bandongan: Kyai membacakan dan menjelaskan kitab sementara santri menyimak dan mencatat makna di bawah tulisan arab.
Metode Sorogan: Santri membaca kitab secara individu di hadapan Kyai untuk dievaluasi kemampuan membaca dan pemahamannya.
Kitab-kitab yang dikaji antara lain: Ihya Ulumuddin, Al-Umm, Fathul Bari, Al-Mughni, Tafsir Ibnu Katsir, dan berbagai kitab hadits.
Program Lainnya
Tahfidz Al-Quran
Program unggulan menghafal 30 juz Al-Quran dengan metode talaqqi dan musyafahah langsung kepada pengajar bersanad.
Madrasah Diniyah
Pendidikan agama Islam komprehensif meliputi fiqih, tauhid, akhlak, nahwu-sharaf, dan kajian kitab kuning.
Program Terpadu (SMP–SMA)
Kombinasi kurikulum nasional (SMP/SMA sederajat) dengan kurikulum pesantren dalam satu atap untuk santri berusia 12–18 tahun.